1 原发性睾丸功能不全
这可能是因为遗传缺陷、睾丸未降、睾丸物理损伤、青春期腮腺炎引起的睾丸功能不全。通常致病因素不明。患有原发性睾丸功能不全的病人，通常睾丸都比较小、柔软，血浆总FSH升高。虽然手术可矫正睾丸未降，但生育能力的恢复有限。
2 阻塞
性传播疾病可引起附睾炎，从而导致输精管系统阻塞，结果造成性无精症。阻塞性无精症可以因先天性附睾或输精管道的其他部位（包括输精管）发育不全所致。这些病例中有些似乎是遗传性的。囊性纤维化病人的先天性双侧输精管发育不全很常见。这些病人中，除双侧输精管发育不全无其他症状的患者至少有三分之二发现了囊性纤维化基因的点突变。这就意味着，有精子产生、但有双侧输精管发育不全的病人适合ART治疗，但必须顾及他们的孩子患囊性纤维化的风险。
输精管切开术 在西方、印度等国采取此法避孕，因此，该原因引起的不育越来越常见。
3 没有生精细胞
许多无精症男性的输精管中只含有足细胞。其原因很多，包括给予细胞毒药物、放射或胎儿期的一些因素
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